Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM27Q9HBJ8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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