Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM47Q96LD4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms