Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF182Q8N6D2 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms