Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TRAPPC6BQ86SZ2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TRAPPC6BQ86SZ2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TRAPPC6BQ86SZ2 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TRAPPC6BQ86SZ2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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