Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms