Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIGFQ07326 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIGFQ07326 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms