Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms