Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SSBP1Q04837 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms