Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPL23P62829 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPL23P62829 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms