Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms