Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMTNP53814 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms