Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN4AP35499 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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