Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP1P29466 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms