Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS1P23219 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms