Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms