Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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