Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms