Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms