Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB4Q9UDY4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms