Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms