Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RNF7Q9UBF6 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RNF7Q9UBF6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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