Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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