Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN3Q9P232 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms