Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FANCFQ9NPI8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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