Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRACR2AQ9BSW2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms