Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3GL3Q99963 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3GL3Q99963 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms