Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms