Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXF1Q12946 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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