Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RPS29P62273 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms