Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms