Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PGGT1BP1-201ENST00000455321 1023 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TCAIM-208ENST00000444602 1056 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LINC01490-201ENST00000548705 638 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SLC14A1-203ENST00000415427 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms