Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NESP48681 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NESP48681 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NESP48681 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms