Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCLCP48506 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCLCP48506 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms