Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms