Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms