Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms