Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TGFB1P01137 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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