Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HMGB1P1B2RPK0 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms