Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PPARGC1AQ9UBK2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PPARGC1AQ9UBK2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PPARGC1AQ9UBK2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PPARGC1AQ9UBK2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PPARGC1AQ9UBK2 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PPARGC1AQ9UBK2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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