Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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