Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms