Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms