Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms