Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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GTF3C6Q969F1 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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GTF3C6Q969F1 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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GTF3C6Q969F1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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GTF3C6Q969F1 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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GTF3C6Q969F1 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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GTF3C6Q969F1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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GTF3C6Q969F1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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