Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms