Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms