Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP34Q70CQ2 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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