Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms