Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms