Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms